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云南省农业科学院是省政府直接领导的多学科、综合性公益性农业科研机构,承担着云南省全局性、关键性、战略性重大农业科技问题的研究任务。建院三十多年来，为云南农业和农村经济的发展,尤其是为主要农产品从长期短缺到基本平衡、丰年有余的历史性转变；为农业生物资源开发支柱产业的形成做出了重要贡献。全院下属15个研究所，挂靠有农业部南方高原农业生物技术重点实验室、国家水稻改良（云南）分中心、农业部农产品质量监督检验测试中心（昆明）等国家、农业部、云南省各类资源圃、繁育中心、重点实验室、检测中心共19个。与州市联合共建有魔芋所、柠檬所等7个研究所。全院学科发展涵盖了主要农业产业和农业科研领域。农作物新品种选育、品种资源收集保存与研究、农业生物技术、分析测试、优质粮经作物种子、种苗生产繁育技术、农业工程咨询设计等更具优势和特色。“十五”期间，获省级以上科技成果奖 69项，育成并通过国家和省农作物新品种审定71个，获专利授权8件，获植物新品种保护13件、占全省授权量的72%，完成成果示范推广5318万亩，增产粮食14.2亿千克，新增产值33.29亿元，为全省农业生产发展提供了强有力的科技支撑。
全院共有在职职工1631人，其中，专业技术人员996人，高级专业技术人员283人，中级专业技术人员442人。在职和在读博士、硕士254人。全国劳模4人，省部级劳模22人，“国突”、“省突”专家21人，省中青年学术学科带头人（后备人才）和省技术创新人才41人，享受国务院及省政府特殊津贴40人。已成为设备先进、学术水平高、研发能力强，对云南省农业发展有重要影响的农业科研机构，是云南农业和农村经济发展中的科技骨干力量。
